La historia comienza en una noche normal, cuando Shido sueña con una voz que grita desde una profunda oscuridad. Cuando se despierta por la mañana, encuentra una caja decorada con patrones de serpentina junto a su cama. Al principio piensa que es una broma y le pregunta a todo el mundo, pero algo sucede cuando la abre.

Tachibana está escribiendo el borrador de la historia del videojuego, y Tsunako está diseñando los personajes. El juego también contará con nuevos espíritus.